Los documentos que tratan del siglo XVI peruano contienen información sobre la transición del Mundo Andino al Mundo colonial y son los más difíciles de consultar debido a su escasez en los archivos históricos. La Unidad de Archivo del Fondo Documental de Estudios Históricos y Arqueológicos presenta el catálogo: Archivo Histórico - Siglo XVI, compuesta por más de 881 unidades documentales y 1441 fichas descriptivas, trabajo realizado siguiendo las Normas Internacionales de Descripción ISAD.-G. Estos documentos en su mayoría proceden de las antiguas escribanías de las ciudades de Cusco, Arequipa y Lima y atestiguan la vida social y económica de sus firmantes, siendo el documento más antiguo de fines de 1535, es decir de los primeros meses de la recién fundada ciudad de Lima.