Un área que ha tenido un desarrollo especial dentro del territorio peruano es la Amazonía. Se aprecian en la sala distintas piezas tanto arqueológicas como etnográficas de distintos grupos que la habitaron.

Expone el desarrollo arqueológico e histórico de los grupos étnicos que habitaron y habitan la más grande región natural del Perú, con 782 880.55 km2, y que ocupa cerca del 61% del territorio nacional.
Uno de estos grupos étnicos fueron los Chachapoyas, que habitaron en los actuales departamentos de Amazonas y San Martín. Construyeron edificios de piedra, de forma circular con frisos de formas geométricas, como el Gran Pajatén y Kuélap, habitados desde el siglo X d. C.
La economía de estos grupos se centra en la caza y pesca, la agricultura itinerante y la recolección. Hacia fines del siglo XIX hubo un cambio en la actividad económica de la selva con la explotación del caucho.